El 22 de diciembre de 2025, Eduardo Villegas fue presentado como entrenador del Club The Strongest, en el que significará el quinto periodo del cochabambino al mando del “Tigre” paceño, con retos muy importantes que se vienen para la institución el 2026.
El primer ciclo de Villegas en la escuadra “Atigrada” se registró el 2004, en aquel momento el timonel valluno ejerció funciones de manera interina, dirigiendo a los paceños en simplemente 7 partidos.
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La segunda oportunidad para Eduardo Villegas llegó el 2005, gestión en la que guio al elenco amarillo y negro en 46 encuentros, dejando como hecho destacado la participación del Club The Strongest en la Copa Sudamericana, evento continental en el cual los “Atigrados” llegaron hasta los cuartos de final.
El 2007 Villegas ejerció su tercer periodo en el “Gualdinegro”, lapso en el que afrontó 17 compromisos, en aquel momento The Strongest se consagró campeón del extinto Torneo de Verano Copa AeroSur, tras derrotar en la serie final al cruceño Oriente Petrolero.
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El cuarto paso de Villegas por Achumani se desarrolló desde 2012 al 2014, llegando a sumar un total de 126 partidos al mando del representativa oro y negro, tiempo en el que sumó tres títulos para las vitrinas “Atigradas”, al ser vencedor de los Torneos Clausura 2011-2012, Apertura 2012-2013 y Apertura 2013-2014.